Tôta a été trahi par Nikitis, qu’il considérait pourtant comme son allié. Au même moment, le repaire de UQ Holder se fait attaquer par Jûzô Shishimi et Shichijûrô Nanao Septo, les deux Numéros les plus puissants du clan ! Ce combat entre immortels, dont un capable de pourfendre les dieux, repousse une fois de plus les limites du possible !

Après l’attaque de Jûzô Shishimi et de Shichijûrô Nanao Septo, les numéros  de UQ Holder doivent affronter plusieurs vampires pure souche menés par Baal. Les immortels  contre les High Daylight Walkers ! Un combat d’une ampleur sans précédent est sur le point d’éclater !

Après avoir vaincu Baal, le High Daylight Walker, les membres de UQ Holder s’offrent un temps de repos  bien mérité. Tôta invite Kurômaru à passer une journée  avec lui pour se détendre mais, soudain, ils se font attaquer par un clan de puissants chasseurs qui considèrent  les immortels comme leurs pires ennemis !

Le clan des chasseurs d’immortels a transformé Kurômaru en sabre divin.  Terrassé pour un temps par une attaque anti-immortalité, Tôta finit par  évoluer à un stade supérieur et vole à la rescousse de Kurômaru. Grâce  à son nouveau pouvoir, il localise son ennemi Yolda Baoth, le mage du  commencement. Il ne reste que peu de temps avant la fin du monde.  Pour les membres de UQ Holder, l’heure de la bataille finale a sonné !

En vue du combat final contre Yolda Baoth, Tôta est enfin arrivé au sommet de la tour, comme il en rêvait… Mais soudain, Baal lance une  attaque surprise. Ce qui s’est passé par la suite ? Il n’en sait rien, car il a  perdu la mémoire… Quarante-trois ans plus tard, il se fait attaquer par un  féroce ennemi à la solde de Baal ! Au bout d’un rude combat au péril  de sa vie, Tôta découvre avec horreur le sort de tous ses amis…

Suite à une longue errance, Tôta a enfin retrouvé tous ses compagnons. Mais leur joie n’est que de courte durée, car ils se font très vite attaquer par une armée de démons et par Ikkû, qui est tombé entre les mains de leurs ennemis. Tôta parvient à repousser leur assaut en libérant Santa de son sceau, et tout le monde rentre au Japon. Là-bas, il apprend ce qu’il s’était passé quarante-cinq ans auparavant. De son côté, Karin dérive seule dans l’espace depuis une éternité et commence à sombrer dans le désespoir…

"Tôta est parvenu à récupérer Karin, qui avait été propulsée à l’autre bout de l’univers, puis Kirié, qui avait basculé dans une dimension parallèle. De son côté, Yolda Baoth, le Mage du Commencement, est entré dans la dernière phase précédant l’activation du Cosmo Entelecheia ! « Je vais sauver le monde et l’humanité, mais je vais aussi libérer Yukihime ! » Le rideau s’ouvre enfin sur l’ultime combat !"

Les membres de UQ Holder sont tombés dans le piège de Baal mais ont réussi à se sortir de ce mauvais pas. Tôta, qui compte sauver Yukihime à l’aide du Mille Vincula, un artefact de Negi Springfield, part à l’assaut de Baal pour enfin libérer celle qu’il aime… Tous les numéros se dirigent vers Charon, le satellite de Pluton ! Mais Baal, puis Yolda, se dressent sur leur chemin et lancent leur sort le plus puissant, le Cosmo Entelecheia ! Alors que l’humanité est sur le point de s’éteindre, Tôta prend une décision inattendue…