La population terrienne en constante augmentation épuise toujours plus les ressources de sa planète. Seule solution pour éviter l'extinction : faire proliférer sur Mars l'unique forme de vie capable d'endurer son environnement et de le rendre habitable... le cafard. An 2599 : La terraformation entre dans sa phase finale et les rampants doivent maintenant être exterminés. À bord du vaisseau spatial Bugs 2", quinze jeunes gens venus des quatre coins du globe, et génétiquement modifiés en vue de cette tâche, s'apprêtent à atterrir sur Mars. Ils ignorent encore tout du sort de leurs prédécesseurs disparus en tentant de remplir la même mission... Et si la théorie de l'évolution ne s'appliquait pas qu'à l'Homme ?

"An 2619. 20 ans après l'échec sanglant de la mission "Bugs 2". Quelque part en Thaïlande, Akari Hizamaru participe à des combats à mort clandestins pour payer l'opération de son amie d'enfance, atteinte d'un virus étranger. Ses capacités physiques surhumaines attirent à lui deux représentants de l'U-Nasa, venus l'enrôler... Sa mission : les aider à trouver sur Mars l'agent pathogène à l'origine du mal de son amie et de plus en plus d'humains. Dans ce but, le commandant Komachi, survivant de "Bugs 2", a bien l'intention de se constituer une équipe de mutants pour affronter une nouvelle fois les cafards humanoïdes !"

"_Avril 2620. Vaisseau spatial "Annex 1", deux heures avant l'atterrissage sur la surface martienne. Les 100 membres de l'équipage essuient une attaque surprise de Terraformars inexplicablement présents à bord. Voyant ses équipes sur le point d'être décimées et contraint par des ordres venus d'en haut, le commandant Komachi doit enclencher l'ultime recours : le plan Delta. Forcés d'évacuer, les membres de la mission se séparent alors dans six navettes dirigées par leurs officiers pour rejoindre Mars. Mais une fois sur place, difficile de se rassembler  quand le comité d'accueil grouille d'hostilité..."

_Planète Mars. Plusieurs heures après l'évacuation d'urgence du vaisseau. L'équipe nippo-américaine menée par Michelle se retrouve confrontée à des Terraformars d'un genre inédit. Afin de protéger ses camarades, Akari et elle devront déployer pleinement leur pouvoir respectif. Mais la bataille s'annonce d'autant plus rude que les spécificités de ses cafards mutants ne sont pas sans rappeler celles des membres de la mission Bug 2 ... L'Humanité n'est pas au bout de ses peines pour exterminer le démon qui règne en maître sur Mars !

"_Planète Mars. 39 jours avant l'arrivée du vaisseau de secours. Adolf et l'équipe germano-sud-américaine sont encerclés par une horde de Terraformars dont les capacités dépassent l'entendement. Plus redoutables que jamais, ils combattent désormais unis comme une véritable armée et ne tardent pas à retourner les armes terriennes contre les humains. Mais c'est compter sans Adolf et ses capacités électriques, qui est prêt à tous les sacrifices pour sauver les hommes et les femmes sous son commandement..."

En dépit des efforts déployés par Keiji Onizuka, l'équipe nippo-américaine n° 1 est sérieusement mise en difficulté par le traquenard que lui ont tendu les cafards mutants de Mars. Pendant ce temps, sur Terre, alors que les dissensions se font de plus en plus vives, d'étonnantes révélations au sujet d'Akari Hizamaru s'apprêtent à jaillir...

Pendant que sur Terre les chefs d'État des plus grandes puissances se réunissent cordialement dans les locaux de l'U-NASA, sur Mars, la bataille fait rage et prend un tour inattendu : Michelle et Akari sont au centre de toutes les convoitises ! Peu à peu, une nouvelle facette du conflit se dévoile... Les cafards n'étaient pas la seule menace !

Planète Mars. Avril 2620. Plusieurs heures après le retour des Terraformars. Du côté des humains, les deux camps ennemis, qui ont chacun essuyé de lourdes pertes, s'occupent de panser leurs blessures et reprennent du poil de la bête. Désormais, il s'agit de savoir qui retrouvera Michelle et Akari en premier. Car si les chinois veulent à tout prix les capturer, les cafards ne manquent pas non plus d'ambition. Ils sont revenus avec davantage de force, d'organisation, et surtout plus déterminés que jamais à régner en maître sur Mars. De leur côté, les deux agents qui attirent les convoitises sont confrontés à une bande de rampants d'un genre plus évolué...

_Planète Mars. 19 avril 2620. L'unité chinoise ayant retourné sa veste, les équipes américano-japonaises et russes s'allient pour terrasser leur nouvel ennemi. Mais alors qu'un combat de colosses s'engage entre les officiers russe et chinois, un essaim de Terraformars se rappelle à leur bon souvenir et encercle les deux partis. Si les rampants ont perdus leur leader, une semaine auparavant, ils ont largement mis ce temps à profit pour tirer des leçons de leurs erreurs et coordonner leurs troupes...

_Nuit du 19 avril. Les membres des équipes nippo-américaines sont dispersés et la communication avec l'U-NASA coupée. Alors que le commandant Komachi, en compagnie des russes, poursuit le traître Liu, le groupe de Marcos et Keiji progressent lentement sous terre pour rejoindre le vaisseau mère et reprendre le contrôle de l'antenne. Mais leur mission s'annonce des plus compliquées à cause de la virulente arme biologique chinoise. Pendant ce temps, Akari, Michelle, Yaeko et Alex, faits prisonniers par Bao, attendent le capitaine chinois. Mais voilà qu'un bataillon de rampants s'apprête à les assaillir. Alors que le vil Bao jette Yaeko en pâture pour faire diversion de sa fuite, Alex se libère et saute du convoi pour la protéger... Désormais encerclés, qui viendra les sauver ?

_À bord de l'Annex 1. Plus que 12 minutes pour rétablir la liaison avec la Terre avant la contamination de l'équipe nippo-américaine. Keiji, seul combattant parmi la troupe d'ingénieurs qui composent le petit groupe d'infiltrés, est parvenu à éliminer son adversaire rampant. La priorité est désormais de se procurer au plus vite des combinaisons avant de rejoindre la salle des systèmes. Malheureusement, en avançant vers leur but, ils sont loin de se douter que le danger est double. Car, si des gardes de l'équipe 4 veillent au grain et attendent de pouvoir les atomiser, le terrible Oniyanma, n'était pas venu les pattes vides... Le compte à rebours est lancé : il ne leur reste qu'un court laps de temps pour hacker l'ordinateur et prévenir la Terre de la situation sur Mars... ou mourir en essayant.

_Planète Mars. Quelques instants après le SOS lancé à l'U-Nasa. Marcos et Jared interviennent in extremis pour secourir les membres à bord du vaisseau-mère, désormais aux mains des Terraformars. Grâce aux efforts combinés d'Amélia et des autres ingénieurs menés par Keiji, la communication a pu être rétablie suffisamment longtemps pour demander des renforts et définir un nouveau point de ralliement. Le mystère reste entier quant aux commanditaires des appareils non autorisés se dirigeant vers Mars, mais les équipes sur place ont bien d'autres préoccupations. En effet, alors que Joseph part seul affronter Liu pour lui arracher sa reddition, les groupes du commandant Komachi et de Michelle subissent de nouveaux les assauts virulents de rampants toujours plus évolués. Le désespoir commence alors à germer parmi les troupes...

_Planète Mars. Peu de temps après l'arrivée du Kuzu-ryû, le vaisseau russe. Alors que les nouveaux arrivants sur Mars tentaient de capturer Akari, Michelle a fait rempart de son corps pour le protéger et reçu un tir mortel. Au comble de la fureur et du désespoir, le jeune homme voit alors s'éveiller le pouvoir qui sommeillait en lui : son héritage maternel. Devenu aussi impitoyable que hors de contrôle, il lance l'offensive contre l'équipage du Kuzu-ryû, la situation restant toutefois fortement défavorable tant l'ennemi est équipé et organisé. C'est alors qu'un miracle sous la forme d'un éclair se produit et bouleverse la donne !

_Planète Terre. 2616. Quatre années avant le lancement de la mission « Annex 1 », le vaisseau « Bugs 1 » faisait sa réapparition dans l'atmosphère terrestre. À son bord, de terribles spécimens Terraformars. Après moult attaques, le monde croyait avoir éradiqués toute la vermine... à tort ! Aujourd'hui, les cancrelats, évolués et prolifiques, se sont appropriés les technologies terriennes et sortent de l'ombre pour passer à l'action... Pendant ce temps, sur Mars, la bataille des survivants continue. Akari, capturé par l'équipage du Kuzuryû semble sur le point de se résoudre à accepter son sort...

_Mars. Une dizaine de minutes avant l'arrivée du vaisseau de secours. L'arrivée du Frontier Spirit est certes imminente, mais il reste aux deux groupes de survivants plusieurs centaines de mètres à parcourir avant d'atteindre le point de rendez-vous... Alors que les cinq officiers, Akari et Eva se serrent les coudes pour faire face aux cafards et aux attaques aériennes du Kuzu-ryû, de leur côté, Marcos, Keiji et le reste de l'équipe se retrouvent confrontés à une véritable marée de cancrelats déchaînés. Avec une unique transformation possible, une seule solution s'offre à eux : foncer droit vers le rivage en se lançant la rage au ventre dans cette monstrueuse mêlée !!

_Arrivée du Frontier Spirit et de son équipage sur la surface martienne. Composés de seulement deux membres, les renforts se révèlent d'un grand secours et parviennent à repousser la horde de cancrelats qui encerclaient les survivants. Si l'embarquement commence enfin, le décollage ne peut pas être indéfiniment repoussé. Les derniers capitaines et le commandant ne disposent donc que d'un délai très court pour les rejoindre. Mais du côté de Shôkichi, la bataille fait toujours rage, et cette fois, c'est un Joseph contaminé par les spores qu'il va devoir affronter !

À bord du vaisseau de secours, de retour sur Terre. Alors que la poignée de survivants déplorent l'échec de leur mission, Ivan décide de leur dévoiler le véritable but de l'équipe russe ainsi que leurs découvertes sur la planète rouge. Ses étonnantes révélations apportent de nouveaux éclaircissements sur les cafards, sur l'ancienne civilisation Rahab et sur l'origine du terrible virus A.E. Sur Mars, aux derniers instants de sa vie, le général Liu revit son passé tragique à travers des flash-back... Le rideau tombe sur la grande bataille dont Mars était le théâtre !

_Planète Terre. Un an après le retour de la mission Annex 1. Parmi les survivants de l'équipe japonaise, certains ont choisi de poursuivre le combat contre la vermine rampante en intégrant la société privée, Hajime Security. Akari, désormais chef de patrouille au siège tokyoïte, protège donc la population qui ignore tout de l'existence des Terraformars dont la menace se fait de plus en plus prégnante. Différents des cafards martiens, ceux-ci semblent avoir un plan pour l'humanité... En effet, des milliers d'habitants ont mystérieusement disparu sans laisser de traces. La guerre se fait désormais à domicile !

_Planète Terre. Japon. En étudiant le cerveau des terraformars capturés, Akari et ses collègues découvrent le sort réservé aux humains mystérieusement disparus. Enfermés en cage, ces derniers doivent subir quotidiennement les horribles expériences scientifiques menés par les rampants infiltrés sur Terre. Une haine viscérale anime alors l'équipe de Hajime Security qui, plus que jamais, souhaite les éradiquer. Certains indices leur permettent de localiser leur laboratoire secret : un îlot artificiel dans la mer de Chine orientale. La mission commando est lancée !

_Planète Terre. Île artificielle, mer de Chine orientale. Aidés par l'unité 4 Spatials , venue leur porter secours, les membres de la société Hajiime Security évacuent le laboratoire. Alors que Michelle et Akari, pris en chasse, tentent de semer les sneakers , Jôichi fait face à l'Invocateur pour récupérer le fruit de ses expériences sur les humains : son propre neveu ! C'est alors qu'apparaît un mystérieux adversaire masqué. Un combattant qui pourrait bien s'avérer être un fantôme du passé...